Hidegindításkor pár másodperces lánccsörgés, később állandó zörej; a lánc megnyúlik, a feszítő nem tartja. Ha a lánc átugrik, a motor belül súlyosan károsodik, és a javítás motorfelújítás. A feszítőt az olajnyomás működteti, ezért álló motornál nem tart: a sebességben hagyott, elguruló autó a lánc ugrásának tipikus kiváltója.

A mechatronika szeleptestének egy vékony fala megrepedhet, ami nyomásvesztést okoz. Jellemző jelek: rángatás és durva váltás 1-ből 2-be alacsony sebességnél, villogó PRNDS-kijelzés, majd fokozat-bekapcsolási hiba, eleinte időszakosan.

A közvetlen befecskendezésnél az üzemanyag nem mossa a beszívószelepeket: a benzin a hengerbe megy, nem a szelep mögé. Az EGR-en és a forgattyúház-szellőzésen érkező olajköd és korom ezért rárakódik a szelepszárra és -tányérra, és 80 000–100 000 kilométertől szűkíti az áramlást. Tünete akadozás, teljesítményvesztés, egyenetlen hidegindítás, gyújtáskimaradás. Nem alkatrészhiba: a szerkezet következménye, ezért visszatér. A tisztítás (dió- vagy szárazjeges) néhány tízezer kilométerre segít.

A hátsó ablakmosó nem permetez, mert a tápláló cső levált. A víz ilyenkor nem az ablakra megy, hanem be, a csomagtérbe.

A 6J-s Ibiza motorháztetője a hajtott élen és az első átmeneti peremen kezd rozsdásodni, nagyjából tízéves kortól. A rozsda ott erősebb, ahol nincs alsó védelem. A magyar utakon télen sóznak, és ott ez így van.

A műszerfalon megjelenik az „Error: Workshop! Only leave vehicle in position P” felirat, hangjelzéssel. Magyar és német nyelvű autóban ugyanez: „Hiba: Szerviz! A járművet csak P helyzetben hagyja el”, illetve „Fehler: Werkstatt! Fahrzeug nur in Stellung P verlassen”.

A 6J-s Ibizán az elektromos ablakemelő motorja zárlatos lesz, és az ablak magától indul meg le vagy fel, vagy éppen meg sem mozdul. A 2015 előtti példányokon ez gyakoribb, és az ajtózár-állítóművek is meghibásodnak.